#1
Es muss an die Aktivierung angekettet werden. Bereits aktivierte Effekte sind nicht betroffen. (Solange die entsprechenden Karten das Spielfeld verlassen haben.)
#2
Die Domäne ist logischerweise negiert. Der Effekttext besagt ja ausdrücklich: Annulliere für den Rest dieses Spielzugs alle Ausrüstungs-, Spielfeld-, Permanenten und Schnellzauberkarten-Effekte auf dem Spielfeld.
Da ist Magiedeflektor aber eindeutig. Er besagt doch, dass für den Rest des Spielzugs alle Effekte besagter Karten annulliert werden. Der Teil auf dem Spielfeld drückt nur aus, dass Effekte von Karten wie Seher der Leere aus dem Friedhof heraus noch verwendet werden können. Es sagt nicht, dass die Karten beim Auflösen von Magiedeflektor bereits offen liegen müssen. (Dann müsste es die sich derzeit auf dem Spielfeld befinden lauten.)
Doch, man kann Schnellzauberkarten erfolgreich an Magiedeflektor anketten, da sie vor Magiedeflektor aufgelöst werden und der Effekt ja nicht rückwirkend negiert wird.
Noch eine Frage zur Domäne:
Was ist, wenn der Gegner Domäne benutzt um die Stufe eines Monarchen zu reduzieren und man später (nicht anketten!) Deflektor aktiviert? Bleibt der Monarch LV6? Die Karte redet ja nur von "zerstört"..
Hier gibt der Kartentext von "Domain of the True Monarchs" einen Hinweis 
"Domain of the True Monarchs": Once per turn: You can reduce the Level of 1 monster with 2800 ATK and 1000 DEF in your hand by 2 until the end of this turn (even after they are Summoned/Set, and even if this card leaves the field).
Der bereits aufgelöste Effekt wird NICHT "nachträglich" durch "Magic Deflector" negiert (vgl. "Forbidden Lance").
Domäne wirkt für mich wie ein permanenter Effekt, den man zünden muss. Und permanente Effekte kann auch Verbotene Lanze "im nachhinein" negieren.
Es ist kein permanenter Effekt, es ist ein Zündeffekt mit einer zusätzlichen Bedingung, nämlich dass das Monster nicht an das Vorhandensein von Domäne gebunden ist. Permanent sind nur Effekt Eins und Zwei.